Grupo de estudo em modelagem molecular - quinta-feira 17h30 E-303

Floresta de Nanotubos de carbono gerada com o DS

Nesta quinta-feira 11/6 às 17:30 na sala E-303 faremos um novo encontro. A proposta será a seguinte:

1) Conferir quem conseguiu fazer a estrutura do nanodispositivo.

2) Gostaria que vocês criassem uma estrutura nanomolecular qualquer com o DS. Quero saber sobre o que vocês tem interesse na área de materiais ou molecular/biomolecular. Desenvolver uma "super droga"? Um material avançado com superfície ultra hidrofóbica constituída por nanotubos? Será que este material inventado pode ser um dia sintetizado? Vamos discutir as possibilidades de estudo em função das sugestões de vocês. Vejam anexo a minha floresta de nanotubos. Qual deve ser a densidade de nanotubos adequada para que haja ressonância entre as estruturas? Efeitos de ressonância podem destruir a estrutura ou levar ao desenvolvimento de propriedades interessantes.... A regra é que o nanomaterial deve ter estrutura química plausível.

3) Verificar se todos tem o VegaZZ e o NAMD instalados. No meu computador só funcionou a versão 32bit do NAMD.

4) Realizar a primeira dinâmica molecular de uma molécula simples.

Assim com esta etapa vocês serão capazes de estudar o comportamento dinâmico das estruturas e futuramente poderão descrever a

1) Análise conformacional

2) Propriedades mecânicas (tensão x deformação)

3) Propriedades termodinâmicas 

4) Atividade química de compostos

5) Atividade biológica de compostos